游戏开始时，关键在于初始精灵的选择，玩家需要从妙蛙种子、小火龙和杰尼龟中挑选一位伙伴，它们各自拥有草、火、水的不同属性并相互克制，这个选择没有绝对优劣，但会影响早期对战策略，熟悉游戏界面和基础操作是顺利冒险的第一步，之后便可在真新镇上方的草丛或常磐森林等早期区域开始初次野外探索并尝试捕捉精灵。
游戏的核心乐趣在于捕捉与培养种类繁多的非传说精灵，玩家可以在遍布各地的草丛、山洞、水域等不同生态环境中遭遇并收服它们，例如火系的六尾、卡蒂狗常出现在特定道路，而水系、虫系精灵则在森林与河流边更为常见，通过战斗积累经验值来提升精灵等级是基础，部分精灵在达到特定等级后会发生进化，从而获得更强的形态与能力，利用如水之石、火之石等进化石也可以促使特定精灵进化，努力提升与精灵的亲密度同样能解锁一些特殊进化。
推进游戏的主线是挑战散布在关都地区的八个道馆，每个道馆馆主专精一种属性，例如尼比市的小刚使用岩石系，华蓝市的小霞使用水系，在挑战前了解属性克制关系并合理搭配自己的队伍至关重要，战胜馆主后不仅能获得徽章以提升精灵控制力与使用特定秘传技能，还能得到技能机器等奖励，在旅程中，玩家需要不断获得并灵活运用秘传技能机，如居合斩用于砍树开路，闪光用于照亮黑暗的岩山隧道，冲浪用于跨越水域，这些技能是探索世界、抵达新区域的必备工具。
丰富的道具系统能显著增强精灵实力与探索效率，在精灵中心可以购买伤药等恢复道具，在彩虹市的大型百货公司则能购得更多重要物品，战斗技巧方面，除了利用属性克制，合理分配精灵体力、学习并搭配不同技能也极为关键，例如让卡比兽凭借高耐久承担防御职责，或让耿鬼利用特攻与催眠进行控场，后期组建一支平衡的队伍需要考虑属性覆盖、技能搭配与精灵的成长潜力，通过挑战路上的训练师、完成支线任务、探索隐藏地点来不断优化自己的阵容，是通关并享受游戏深度内容的核心。
